经某现代农业有限公司职工陶某举离职后被告知原始档案资料丢失、管理混乱，给企业造成重大经济损失，企业还向劳动人事争议仲裁委员会申请了仲裁。陶某举不服，向法院提起诉讼。

法院认为，没有证据或者证据不足以证明当事人的事实主张的，由负有举证责任的当事人承担不利后果。

在本案中，根据该公司的自述，公司是根据陶某举离职前统计并制作的库存损失表，通过计算产品结存数量与盘存数量的差，参照其单方面制作的金融系统中某产品情况表记载的产品单价，制作出仓库盘存差异统计汇总表，合计金额为390476.7元。

但根据该表仅能证实当时的库存现状，不能证实存在缺失，且该表中有缺失也有多余，说明该公司对库存管理并不正规，所提供的证据也不能证实损失与陶某举之间存在因果关系，因此该公司承担举证不能的法律后果。

在本案中，陶某举是公司的行政人员，具体负责人事、档案等工作，无管理仓库的职责，亦无造成损失赔偿的相关规定，而是在仓管人员不在时配合工作，并非仓库的实际管理人。

最后根据该公司在一审中提交的证据，该盘点表中显示同一名称、不同装袋规格的枣子既有盈余的情况，也有亏损的情况，但某现代农业有限公司在计算时只对亏损情况进行了统计、折价，对同一名称、不同装袋规格存在盈余的枣子并未统计，存在不合理的情形。

依照《中华人民共和国民事诉讼法》第六十四条、《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第九十条之规定，判决陶某举无需向某现代农业有限公司赔偿重大经济损失390476.7元。