受“梅花”影响，9月14日下午至15日上午上海市将出现最强风雨影响，沿江沿海地区风力10-12级，洋山港区和上海市沿海海面12-14级。9月13日上午9时，上海海事局启动IV级防汛防台应急响应，上海海事局所属部分沿海分支局（洋山港、金山、吴淞、浦东、崇明海事局）启动III级防汛防台应急响应。

截至9月13日14时，崇明三岛客轮、洋山客轮均已停航（长横渡船除外），黄浦江游览船、轮渡视情况采取停航、避风等措施。长江口及洋山水域共疏散船舶516艘次。本次水上防台工作，上海海事部门在确保安全的前提下，充分用足黄浦江等避风条件良好的水域资源，强化对崇明岛西南、黄浦江水域等停泊密集区现场监管力度，加强与江苏、浙江以及上海市内河等相邻海事管理机构的沟通协调，共同做好船舶避风组织。

上海海事局在总结防御11号台风“轩岚诺”经验的基础上，充分考虑台风“梅花”正面袭击上海海事局辖区的最不利情况，做好防强风、抢大险的准备，进一步把各项防台措施落实落细。海事部门密切关注台风动向，根据气象、海洋部门预报预警信息，通过VHF（甚高频）、短信微信和现场巡逻艇宣传等渠道开展广播和宣传，加强对长江口南北航路船舶、长江口锚泊船舶、涉渔船舶的提醒和预警。海事部门对辖区应急力量值守情况进行全面测试，加强桥区水域、风电场、锚地以及台风期间锚泊、停泊船舶较为集中的水域等重点区域的应急力量部署。